Las nuevas llegadas siguen (las de plantas y animales)

Una nueva invasora peligrosa en México, Hyparrhenia variabilis.

En las últimas dos décadas se han tomado varias medidas para frenar el intercambio de plantas y animales que puedan establecerse en regiones lejanas de su origen, y allí causar problemas, ya sea para los ecosistemas nativos o para el aprovechamiento agropecuario (o sea, los organismos invasores).

Un nuevo artículo en Nature muestra que el intercambio de plantas, animales y microorganismos se sigue fortaleciendo - es dificil controlar tanta gente y bienes que se mueven:

Esta gráfica muestra los nuevos registros de especies exóticas o introducidas y naturalizadas por año para todos los organismos estudiados.

Sin embargo, las tendencias son muy variados en los diferentes grupos taxonómicos. En plantas vasculares parece existir una tendencia a la estabilización, pero en insectos y varios otros grupos se observan incrementos altos:

En esta gráfica se muestra lo mismo, pero para los diferentes grupos taxonómicos (plantas vasculares, musgos, algas, mamíferos, aves, etc.)

Claro, también puede ser porque ahora se hacen más caso a las nuevas observaciones que antes, pero por lo general debe reflejar lo que está pasando.

El artículo además contiene unas estadísticas interesantes sobre la relación entre el volumen de comercio y el número de nuevas especies registradas:

Relación del registro de nuevas especies introducidas establecidas, y el volumen de comercio

En algunos grupos hay relaciones que parecen muy cercanas, y en otras no.

Todo esto es interesante y se puede usar como base para desarrollar más explicaciones para los fenómenos de intercambio biótico global que estamos observando.

Aquí tengo un comentario para entender bien estos datos. No hay que confundir organismos introducidas con invasores - algunos introducidos con invasores, pero no todos, ni siquiera la mayoría (y esto varía también entre grupos taxonómicos). El problema es que generalmente no sabemos de antemano cuál introducido se volverá invasor, por esto combatimos a todos. Por ejemplo, el pasto que muestro al inicio no ha sido reportado como invasora seria de otras partes del mundo. Pero, de todas maneras no hay que mezclar los conceptos.

Seebens, H., T. M. Blackburn, E. E. Dyer, et al. (2017) No saturation in the accumulation of alien species worldwide. Nature Communications 8:14435.

Una reseña en Science:
Asher, C. (2017) Alien species are accelerating their march across the globe. Science. doi: 10.1126/science.aal0762

Herramientas para académic@s: respaldar correos-e

A tod@s nos ha pasado.

De repente me hackearon y ya no puedo entrar a mi cuenta de correo. De repente todo está borrado. De repente el servidor de mi institución tiene un problema y pierde correos. De repente Yahoo o Google sufren un ataque cibernético. De repente me despiden y ¿donde encuentro ahora los datos de mis contactos?

Si bien el correo electrónico está perdiendo peso en la comunicación cotidiana (donde dominan las redes sociales), sigue siendo de suma importancia como herramienta laboral - prácticamente ha sustituido la correspondencia formal de antaño. Entramos en contacto con nuevas personas, enviamos trabajos, nos enteramos de acontecimiento de nuestro ambiente y coordinamos colaboraciones.

Una de las ventajas (y desventajas) de los correos electrónicos es que son cuasi-archivales - rastreables, no tan permanente como el papel, pero sí con una vida que se cuenta en décadas. Desafortunadamente, les pueden pasar cosas, como mencioné arriba. Así que eviten esta situación:

... y hagan RESPALDOS, de preferencia en varios lugares. Alguna gente usa un cliente de correos, como Outlook, que se puede configurar para que transfiera los correos automáticamente a la computadora. Pero, tiene sus desventajas si uno trabaja en varias computadoras, p.ej., una en la casa y otra en el trabajo.

Entonces, les quiero presentar algunas posibilidades para respaldar correos en una computadora en archivos que se pueden mover de una máquina a la otra, y sin afectar a las cuentas de correo en sí.

Lo que uso regularmente, sobre todo para mi correo del trabajo, es un programa que se llama Mailstore; tiene una versión de paga para empresas, y una versión gratuita (!), Mailstore Home, para usuarios individuales. El enlace para bajar la versión original en inglés es http://www.mailstore.com/en/mailstore-home-email-archiving.aspx; también pueden googlear versiones en español.

Este programa es muy fácil de usar, simplemente se indican las carpetas que se desean guardar, se corre de vez en cuando para tener los correos más recientes, se pueden abrir y buscar, cada vez que se hace respaldo se borran y añaden los correos como las tienes en tu cuenta, y hace un archivo que puedes transferir a un disco duro externo o algún otro dispositivo. Nada mas cuidado: una vez que está en tu compu, cualquiera que tiene acceso a ésta puede leer tus correos. Si contienen material confidencial, es aconsejable proteger la carpeta o el dispositivo con una palabra clave.

Funciona para los correos de Windows y Microsoft (como el Outlook Web App que tenemos en el trabajo), para Gmail, Mozilla Thunderbird y para Yahoo.

Google tiene otra alternativa: vas a la página Takeout, y te permite respaldar muchas partes de tu cuenta, como blogger, tu calendario, tus contactos, lo que tienes en drive, y también tus correos.

Desafortunadamente, todavía no he encontrado una herramienta fácil para respaldar a mis correos en Hotmail. Si googlean Hotmail backup aparecen una serie de programas, pero no sé qué tan buenos y confiables son y no los he probado. Una posibilidad sería configurar la cuenta (en Opciones-Cuenta-Reenvío) de tal manera que mande una copia de todos los correos a otra cuenta, p.ej. en Gmail. Pero esto no parece muy satisfactorio. Así que si alguien ha encontrado una manera fácil y rápida para respaldar una cuenta de Hotmail, agradezco un comentario.

La Chinantla, ¡conózcala!

Para los que les gustan las selvas: hace unos días una ex-alumna, Elena Galindo, compartió varios videos en Facebook sobre oportunidades para viajar y visitar pueblos en la región de la Chinantla, que se encuentra la parte tropical del noreste de Oaxaca. Es relativamente retirada, tanto de la ciudad de Oaxaca como de Tuxtepec son 5-6 horas, pero vale la pena.

Aquí van, para los que quieren planear sus viajes de Semana Santa, o simplemente quieren saber más de la región. También hay un video de la CONANP que no pude insertar, porque solo se publicó en Facebook. Los monitos araña arriba son de este video.


San Mateo Yetla, Oaxaca

Balneario Monte Flor, Oaxaca

Zuzul, en Vega del Sol, Oaxaca (por cierto, el balneario se llena bastante en Semana Santa)

Sobre Santa Cruz Tepetotutla, Usla:

Y aquí todavía los enlaces al reporte de una práctica de campo que hicimos hace unos años precisamente en esta región:

• Salida de campo 2011: la milpa
• El cultivo del hule ... una plantación en la región de la Chinantla
• Tortilla de yuca estilo chinanteco

Curso de Ilustración Científica Botánica

Después del curso de fotografía de la semana pasada, les puedo anunciar ahora otro curso para ilustradores naturalistas. La Academia de San Carlos está ofreciendo un curso intensivo (80 h) en esta especialidad. Inicia pronto, en una semana y se lleva a cabo dos veces a la semana, cuatro horas cada sesión (viernes por la tarde y sábado en la mañana). Sí cuesta (5500 pesos) pero parece que dan facilidades.

Creo que es el mismo curso que se anuncia como curso sobre "Ilustración científica empleando elementos pictóricos" anunciado en la página web del FAD (Facultad de Artes y Diseño, UNAM). Suena bastante interesante. Si tuviera tiempo, iria. Se puede uno inscribir hasta el último día de febrero.
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Actualización: el correo-e es educontinua.sancarlos@gmail.com y los teléfonos (55) 5522 3102 y (55) 5522 0630 ext. 224.

El HERITH, un herbario regional

De Ivan Daniel Salas Mendez 

Logo institucional del Herbario HERITH

Mi nombre es Iván Daniel, de lunes a viernes yo era feliz en el herbario institucional de mi escuela donde me formaba como biólogo, colaborando como determinador. Ingresé en el mes de abril del 2012 y finalizé en diciembre del 2015. Para mi el herbario era mi refugio donde reía, lloraba, aprendía y disfrutaba cada encuentro con las plantas, con mis compañeros y con la curadora de tal lugar.

Les compartiré un poco de historia y el andar del HERITH por la Huasteca Hidalguense.

El Herbario del Instituto Tecnológico de Huejutla en el estado de Hidalgo tiene el acrónimo HERITH. Se fundó en enero de 1999, por iniciativa individual de la Bióloga Sol de Mayo Araucana Mejenes-López, quien fue responsable del acervo hasta el 2 de julio del 2014. En abril de 2002 se obtuvo el registro formal ante SEMARNAT (clave HGO-FLO-124-04-02).

Registro del acervo ante SEMARNAT

Primeros estudiantes del HERITH de residencia profesional realizando
trabajo de laboratorio y gabinete

El herbario pretende establecer y consolidar una colección de flora de forma activa, educativa y de estudios científicos que represente la región Huasteca y Sierra de Hidalgo. Igualmente, quiere impulsar y difundir el conocimiento de la flora regional.

Ejemplares depositados en el Herbario HERITH

El acervo ha contado con la participación eficaz de estudiantes de la Licenciatura en Biología desde 1999 hasta hoy en día en las modalidades de servicio social, residencia profesional y tesis.

Alumnos y equipo desarrollando actividades de campo

Los estudiantes provenientes de varios lugares de la Huasteca y Sierra de Hidalgo han contribuido directamente en el incremento del acervo.

Región sierra y huasteca de Hidalgo 

La colección cuenta con un área de 36 m2, la cual consta de dos gabinetes tipo herbario y tres gavetas de resguardo, una estufa de madera, un acervo de literatura  (libros, monografías, artículos, Floras nacionales, claves dicotómicas, revistas, entre otros). El acervo está conformado por 1476 ejemplares y estos a su vez estan distribuidos en 106 familias botánicas, 266 géneros y 295 especies. 

El Herbario HERITH se fumiga con químicos y la revisión de los ejemplares es cada tres meses.

Gavetas con ejemplares y estereoscopios

Computadora, material de laboratorio, literatura y logo del HERITH

Se tiene un manejo permanente de actualización, manejo y mantenimiento del acervo. 

Desde 1999 hasta la fecha los trabajos han sido enfocados principalmente en listados taxonómicos en sitios de de vegetación de Selva Mediana Subperennifolia y Bosque Mesófilo de Montaña.

Tesistas y residentes profesionales monitoreando la flora de la región

Prensado de ejemplares en Selva Mediana Subperennifolia

Recorrido en sitios de muestreo

La participación en foros académicos científicos forma parte fundamental para la colección de flora, como la intervención de ferias ambientales, Semanas Nacionales de Ciencia y Tecnología, encuentros de Herbarios, de Investigación y Desarrollo Tecnológico y Congresos Nacionales e Internacionales de Etnobiología y Botánica.
 

Promoción del Herbario HERITH

Feria ambiental en Huejutla de Reyes, Hidalgo

Pláticas sobre flora regional a niños de primaria

Participando en el IX Congreso Mexicano de Etnobiología en
San Cristóbal de las Casas, Chiapas

Actualmente la curadora del Herbario es la doctora Dorismilda Martínez Cabrera. La consulta de ejemplares es de lunes a viernes con horario de 9:00 a 14:00 horas.

En conclusión, la colección del Herbario pretende ser un acervo, cuyos propósitos estan encaminados a la docencia e investigaciones científicas así como difusión a corto, mediano y largo plazo para proponer un manejo acorde a la región de los recursos florísticos de la región Huasteca y Sierra de Hidalgo.

Actualmente el HERITH lleva el nombre de quien inició este proyecto
(Sol de Mayo Araucana Mejenes-López)

CONTACTO
Herbario (HERITH)
Instituto Tecnológico de Huejutla,
Carretera Huejutla-Chalahuiyapa, Km 5.5
Huejutla de Reyes, Hidalgo
Teléfono: (01-789) 896-06-48
Email: dir_huejutla@tecnm.mx

GRACIAS HERITH...

Por todos los momentos vividos ahí,

por permitirme conocer gente extraordinaria y que marcó mi vida,

por mostrarme las maravillas del reino vegetal,

por traer consigo grandes satisfacciones profesionales y personales,

pero principalmente por formarme como Biólogo.

IVAN DANIEL SALAS MENDEZ

Estabilidad produce diversidad

Hotspots reconocidos actualmente a nivel mundial. Con definidos como regiones que tiene más de 1500 especies endémicas y una conversión (=modificación) de hábitat mayor de 70 %. Fuente: Harrison & Noss, 2017.

Muchos biólogos conocen el término "hotspot". Lo usamos para referirnos a regiones que tienen una diversidad vegetal o animal mucho más alta que la normal, particularmente de especies con una distribución restringida (endémicas). Estas regiones a menudo son montañosos - una superficie agreste promueve el aislamiento de poblaciones, y con esto la diferenciación y evolución de nuevas especies (los llamados neoendemismos).

Pero, hay otro factor. Montañas también amortiguan variaciones climáticas. Si vives en una planicie y el clima se vuelve más caluroso, no tienes adonde ir y te mueres. Si vives en una sierra, puedes subir a lugares más templados (y bajar otra vez, según el caso). Entonces, vives en un refugio.

Corrientes marítimas también disminuyen el efecto de cambios climáticos. No es ofreciendo un escape, sino a traves de la adsorpción o liberación de calor - el agua guarda calor mucho mejor que la tierra. Así los corrientes suavizan los cambios en la temperatura.

Se ha propuesto desde hace tiempo que hay una relación entre hotspots y los llamados refugios, sitios donde las variaciones climáticas en el pasado fueron menos bruscos. Ahora, un nuevo trabajo de revisión examina esta hipótesis y sugiere que sí existe esta relación, o sea, que los centros de endemismos están ligados a sitios que funcionaron como refugios. Incluye datos filogenéticos nuevos. Vayan a leerlo; afortunadamente es de acceso libre.

Referencia

Harrison, S. y R. Noss. 2017. Endemism hotspots are linked to stable climatic refugia. Annals of Botany 119, 207–214. doi:10.1093/aob/mcw248

El compendio global de malezas - tercera edición

Hace unos días se publicó la tercera edición de un recurso muy útil, el compendio global de malezas (Global Compendium of Weeds). Es la version en pdf de una base de datos compilado por Rod Randall, un investigador australiano (ver los enlaces abajo).

Es un listado (con revisión de sinonímia) de todas las malezas que el autor pudo encontrar en referencias a nivel mundial. Incluye más de 35 000 nombres en más de 3600 páginas, que será útil sobre todo para aquellos que necesitan información rápida sobre una especie: si se considera maleza en alguna parte del mundo, y donde se distribuye.

Adicionalmente, se indica el número de referencias en las que se basa la entrada, una indicador de que tan riesgosa es la planta, si es tóxica o acuática, la forma de vida, el tipo de clima, el origen (en términos muy generales), vías de dispersión y de introducción, longevidad de las semillas, cultivos impactados, e indicaciones sobre su comportamiento en las diferentes regiones donde se presenta, por ejemplo, si es una maleza agrícola, si es naturalizada o si es reglamentada.

Aquí hay un resumen de los datos:

A continuación les presento unas estadísticas interesantes sobre las vías de dispersión (principalmente por humanos y animales) y de introducción (principalmente para ornamental):

Además, les dejo dos páginas para darles una idea, una con el género Cosmos y otra con el género Simsia, dos grupos de plantas que se diversificaron en Mesoamérica (hacer clic en la imagen para verlo en grande):

Se pueden encontrar algunos errores o decisiones con los que uno no puede estar de acuerdo - ejemplos son la inclusión de México en Centroamérica (en vez de Norteamérica), la sinonimia de Bidens odorata con Bidens pilosa (que son dos cosas muy distintas, a pesar de lo que dice la Flora de Norteamérica), o la falta de un criterio unificado para considerar una planta maleza, lo cual lleva a un número mucho más alto de malezas para EUA (casi 10,000, que representaría la mitad de su flora total) que México. Pero no deja de ser un trabajo monumental y muy útil.


Referencia

Randall, R.P. (2017). A Global Compendium of Weeds. 3rd Edition. Perth, Western Australia. R.P. Randall.

El autor pone la obra a disposición en este enlace: https://www.researchgate.net/publication/313645439_A_Global_Compendium_of_Weeds_Third_Edition
También pide que se distribuya y se haga disponible desde otros sitios, así que me permití subirlo a GoogleDocs; lo pueden bajar haciendo clic aquí.
Pero cuidado: son 68 MB.

¿Quieres mejorar tus dones para tomar fotos de la naturaleza?

Jorge Neyra Jáuregui, experto en todo lo que tiene que ver con la naturaleza de la alta montaña de México, está ofreciendo unos cursos en campo sobre fotografía. Inician este fin de semana. Le pueden escribir para obtener más información, también sobre costos.

Video del fin de semana: El árbol del arcoiris

Eucalyptus deglupta, el árbol arcoiris (Fuente: Wikipedia, foto de Paxton Woelber)

En la isla sureña de las Filipinas crece el único eucalipto nativo del hemisferio norte. Y es un árbol muy especial: su corteza es extremadamente colorido. Disfruten esta maravilla en el video que publicó el Missouri Botanical Garden, y con esto Jehuite se va de vacaciones dos semanas, hasta los primeros días de enero.

Tercer Congreso Internacional de Ingeniería Ambiental

En dos semanas, del 21 al 23 de febrero, se celebra el 3r Congreso Internacional de Ingeniería Ambiental en Villahermosa, Tabasco. Parece que es un evento grande (y organizado más bien en forma empresarial, incluyendo música algo molesta en la página web del evento). Pero, es probable que interese a varios lectores de este blog, así que les aviso.

No encontré una fecha límite para someter resumenes. Pero pueden preguntar a través de la página Facebook; parece que los organizadores contestan rápidamente. Aquí encuentran los costos (perdon: inversiones). Las indicaciones para los resumenes están aquí.

Flora de Norteamérica: Volumen 12

Acaba de salir formalmente el tomo 12 de la Flora de Norteamérica al norte de México (Flora of Northamerica north of Mexico). Con este, ya se cuentan con 20 tomos de los 30 proyectados. Esta Flora es especialmente útil en el norte de México, y para identificar plantas introducidas y malezas de amplia distribución.

Da mucho gusto - y ayuda - que ahora se terminaron formalmente 29 familias adicionales. Las más importantes son Euphorbiaceae/Phyllanthaceae (yay!), Celastraceae, Linaceae, Loasaceae, Malpighiaceae, Oxalidaceae, Rhamnaceae, Viscaceae, Vitaceae y Zygophyllaceae.Varias de las familias tratadas ya se encontraron parcialmente en la versión en línea del proyecto (parece que hasta hoy todavía no se actualizaron todos los enlaces en el listado de familias).

Desapareció Beall's List de revistas científicas depredadoras

El sábado pasado me llegó una solicitud de arbitraje de una revista que no conocía. Hice lo que siempre hago en estos casos: intenté recurrir a la llamada "Beall's List", un sitio web llamado Scholarly Open Access mantenido por un bibliotecario de Estados Unidos, Jeffrey Beall, que contenía una lista de revistas que él no consideraba serias, o predatorias (una traducción usada a menudo para la palabra inglés "predatory" - creo que depredador es mejor). No es que tomo su palabra como escrita en piedra, pero sí tenía una perspectiva a tomar en cuenta. También visitaba su blog periódicamente, para ver qué nuevas graciosidades habían ocurrido, como pagos por citas.

Y resulta que desapareció el sitio.

Ya desde hace tiempo quería escribir sobre el creciente ecosistema de revistas científicas chafas, piraterías, conferencias poco serias, revisores de estilo apócrifos y demás, pero esto lo haga aparte. Ahora quiero enfocar en este evento.

Un poco más de googleo reveló poca información y mucha ansiedad expresado por parte de científicos.

Parece que se canceló el blog y sus listados de editoriales y revistas que eran, según el Dr. Beall, depredadores, de un día para otro, sin aviso y sin mayor justificación. Esto sí, todavía existe una página anónima con el mismo diseño gráfico y una dirección que pretende confundir (scholarlyoa.net en vez de scholarlyoa.com) sobre el "académico bloguero depredador terrorista Jeffrey Beall".

La comunidad de internautas sospecha dos causas: una amenaza de demanda jurídica que no quiso defender (de las cuales ya hubo varias) y/o una presión por parte de gente con $$$ sobre su universidad. Pero realmente no sabemos. El viernes pasado se publicó parte de una conservación de Dr. Beall con un amigo bloguero, pero tampoco aclarece mucho.

Afortunadamente, todavía hay versiones guardadas de sus listados en otras partes del internet. Pueden encontrar el listado de revistas solas y la de los editoriales. Si les son útiles, sugiero que los bajen mientras todavía están disponibles. Pero claro, ya no se van a actualizar. Y tampoco tenemos un lugar que nos informe de las últimas formas de estafas.

Todo esto les da una idea de cómo está la presión sobre el negocio de publicaciones científicos. Lo que más coraje da es que prácticamente todo el trabajo serio se hace en forma gratuita (autores, revisores, editores) y solo algunos aprovechan el último paso (de lo cual tampoco quiero exentar las editoriales grandes, pero más o menos serios, como Elsevier, Springer, etc.). Sí es cierto que personas que saben bien el inglés y tienen experiencia pueden detectar revistas chafas, pero cuesta tiempo que mejor invertimos en otros quehaceres. Y para los que no saben bien el inglés o no tienen tanta experiencia es muy fácil caer en alguna trampa.

Cabe mencionar que el Directorio de Revistas de Acceso Libre (DOAJ, Directory of Open Access Journals) adoptó estandares más estrictos para la inclusión de revistas en su directorio el año pasado, así que pueden consultar esta fuente también, que antes era un poco dudosa. Latindex tiene una política muy transparente, enlistando criterios y diciendo cuales son cumplidos por las revistas y cuales no (aquí el ejemplo de Botanical Sciences impreso).

Aquí les dejo algunos artículos que han circulado sobre el tema en la red (y como siempre, los comentarios abajo de los artículos a menudo son lo más interesante):

Mystery as controversial list of predatory publishers disappears (Science)
The predatory publishers list goes dark (también Science, pero una vista más personal que resume la problemática)
Controversial website that lists "predatory" publishers shuts down (Nature)
Why did Beall's List of potential predatory publishers go dark? (Retraction Watch)
No more "Beall's List" (Inside Higher Ed)
Beall's list of "predatory" publishers and journals no longer available (Editage Insights)
Website that tracked fake science journals has suddenly vanished (IFL Science)
World's main list of "predatory" science publishers vanishes with no warning (Starship Earth: the Big Picture, un blog)
A famed journal blacklist is dead. Long live a blacklist! (STAT)

El herbario CHAPA

El Colegio de Postgraduados cuenta con un herbario institucional único, el Herbario-Hortorio, asociado al Posgrado en Botánica. De lo que yo sepa es el único herbario en México que incluye específicamente a las plantas cultivadas en sus colectas, de allí el nombre de Hortorio.

La entrada al herbario CHAPA

El Dr. Steven Koch, profesor-investigador del posgrado y taxónomo importante de pastos mexicanos, lo fundó en 1973, y cuidó este herbario durante décadas con mucha dedicación y esmero. Desafortunadamente, falleció recientemente. Todavía no hay un sucesor designado, ya que en el Colegio de Postgraduados no se llenan plazas automáticamente cuando el titular fallece, se jubila o acepta otro trabajo. Estamos haciendo lo posible para obtener el visto bueno de la institución para fortalecer el área de taxonomía y sistemática vegetal, y para volver a encargar el herbario a un curador experto.

Los gabinetes

 
El herbario tiene el acrónimo CHAPA y ha crecido a aproximadamente 160,000 ejemplares montados e intercalados en la colección de consulta. Es de acceso público, con un horario de 8 a 4. Contamos con microscopios estereoscópicos y la demás infraestructura necesaria para una colección de este tipo, así como una biblioteca especializada anexa. Recientemente se digitalizaron los ejemplares tipo con la colaboración del M. en C. Ricardo Vega Muñoz, técnico del herbario; pueden encontrar las imágenes aquí en JSTOR.

Quisiera avisar que una servidora fue nombrada como encargada y curadora interina de esta colección. Pueden comunicarse conmigo ya sea por mis correos normales, o a través del correo chapa@colpos.mx. Haré lo que puedo para mantener y mejorar el herbario, los programas de intercambio y las demás actividades propias de herbarios, hasta que se regularice la situación.

Vista de la colección