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jueves, 25 de abril de 2024

Coloquio: La computadora en el herbario. Reflexiones de 57 años de trabajo

De Santa Lucía Quintero Bastida

Este año 2024 el Instituto de Biología de la Universidad Nacional Autónoma de México (IBUNAM) cumple 95 años desde su fundación. Es una de las grandes instituciones de investigación en materia biológica a nivel nacional. Su principal propósito ha sido el estudio de la composición, distribución, origen y usos potenciales de biodiversidad de México. El IBUNAM tiene a su resguardo las siguientes colecciones y bases de datos.


Figura 1. Logo 95 aniversario IBUNAM
Fuente: IBUNAM 

Las colecciones que resguarda el Instituto de Biología son consideradas patrimonio documental y científico de la nación, ya que es ahí donde se encuentra depositado el mayor acervo de información sobre la biodiversidad mexicana. 

Figura 2. La computadora en el herbario
Fuente: IBUNAM

En el marco de su 95 aniversario el IBUNAM se complace en invitar al coloquio “La Computadora en el Herbario. Reflexiones de 57 años de trabajo” que tendrá lugar el 2 y 3 de mayo en el auditorio del Jardín Botánico en C.U. En dicho evento destacados expertos compartirán sus experiencias sobre investigaciones y los logros que han tenido en el camino a la sistematización informática de los herbarios en México.

 
Figura 3. Chip de computadora (alusivo a la importancia de la sistematización informática de los herbarios)
Fuente: IBUNAM 


A continuación se presenta parte del programa de ponencias del evento. Puedes consultar el programa completo aquí








Te presentamos algunos de los ponentes que compartirán sus experiencias, avances y aportes a la sistematización de la información en materia biológica. 

Ponente: Dr. José Luis Villaseñor Ríos
Institución: Departamento de Botánica, IB-UNAM 
Título de la ponencia: El uso de las bases de datos de herbarios en el análisis de la biodiversidad 
Fecha y hora: 2 de mayo de 2024 de 9:45 - 10:30 hrs
Semblanza curricular: Botánico con estudios de posgrado en la UNAM y en el extranjero (California, USA). Desde 1991 investigador del Departamento de Botánica, Instituto de Biología, UNAM. Es miembro del SNII desde 1986 (a partir de 2024 Investigador Emérito). Sus líneas de investigación son la Sistemática Vegetal, la Fitogeografía, la Biología de la Conservación y la Informática de la Biodiversidad, orientados a evaluar los patrones, tanto de riqueza de especies como de distribución geográfica, ya sea a escala local, regional o nacional. Es autor o coautor de 300 publicaciones, entre las que destacan 245 artículos, 14 libros y 17 capítulos de libros. 

Ponente: Dra. Victoria Sosa Ortega
Institución: INECOL 
Título de la ponencia: eFloraMEX: la flora electrónica de México; "Implementación de la eFloraMEX en la plataforma EDIT" 
Fecha y hora: 3 de mayo de 2024 de 9:00 - 9:30 hrs 
Semblanza curricular: Victoria Sosa estudió la licenciatura en biología por la UNAM y el doctorado en ciencias por la Universidad de California, Berkeley. Actualmente es Investigadora Titular D en el Instituto de Ecología AC, INECOL, de Xalapa, Veracruz. e Investigadora Emérita del Sistema Nacional de Investigadores. Ha publicado 120 artículos indizados y 51 publicaciones de índole taxonómica, divulgación y enseñanza. Ha dirigido 38 tesis (15 de doctorado). Profesora titular en cursos de taxonomía y sistemática del posgrado del INECOL. Ha participado en diversas comisiones evaluadoras y comités directivos nacionales e internacionales, como la Red Latinoamericana de Botánica. Fungió como Presidenta de la Sociedad Botánica Mexicana. 

Ponente: Enrique Ortiz Bermúdez
Institución: Departamento de Botánica, IB-UNAM 
Título de la ponencia: La Identificación automatizada, AbaTax 
Fecha y hora: 3 de mayo de 2024 de 12:20 - 12:50 hrs 
Semblanza curricular: Es Biólogo y Maestro en Ciencias por la Facultad de Ciencias de la Universidad Nacional Autónoma de México. Se ha especializado en el manejo de sistemas de información geográfica y percepción remota. Sus áreas de estudio son la Biogeografía, Bioinformática, Florística, Sistemática de la Conservación y Taxonomía y Sistemática Filogenética. 

Conoce a todos los ponentes aquí

Es importante registrarse para reservar un lugar en el evento ya que el recinto tiene un aforo de 100 personas. ¡El registro es totalmente gratuito!

Si no puedes asistir de forma presencial, no te preocupes, puedes seguir la transmisión en vivo a través del canal del IB UNAM @SeminariosIB en Youtube

¡No te lo pierdas!

lunes, 15 de abril de 2024

¿Te gustan las plantas? ¡Vamos a colectar!

De Verónica Rodríguez Tellez

En el mundo de las ciencias biológicas es necesaria la recolección y conservación de ejemplares físicos de organismos (animales, plantas, hongos, algas y bacterias) para estudiarlas posteriormente. A esto se le denomina colecta y cada reino biológico tiene sus métodos particulares para llevar a cabo dicha acción. Hoy nos vamos a enfocar en plantas.

Los cinco reinos biológicos (Fuente: Flickr, CC BY 2.0)

PERO ANTES, ¿Por qué es importante la colecta de ejemplares para colecciones?, según la Organización del Tratado de Cooperación Amazónica (OTCA) esta actividad es importante ya que sirve como un acervo de material biologico para investigación cientifica, influye en la enseñanza y la documentación de conocimiento. Es la base para obras que enlistan y describen a especies y apoya a investigadores y practicantes en el manejo de especies. Con esta información también se puede modelar la distribución geográfica de las especies y así elaborar mapas de distribución y averiguar rutas de dispersión.

Para las plantas es deseable obtener un permiso que avale nuestras actividades. Hay varias modalidades que se pueden encontrar en la página de Trámites del la SEMARNAT relacionadas con la vida silvestre. Los más relevantes son: SEMARNAT-08-049-A - Licencia de colecta científica o con propósitos de enseñanza. Modalidad A. Por línea de investigación; SEMARNAT-08-049-B - Licencia de colecta científica o con propósitos de enseñanza, en materia de vida silvestre. Modalidad B. Por proyecto
SEMARNAT-08-049-C - Licencia de colecta científica o con propósitos de enseñanza, en materia de vida silvestre. Modalidad C. Con propósitos de enseñanza. 
 
Estos permisos se pueden tramitar en las oficinas que se encuentran en el Espacio de Contacto Ciudadano (ECC) de la Dirección General de Vida Silvestre (DGVS) en la Ciudad de México (en Viveros) y solo puede hacerse en ventanillas, aunque se puede obtener asesoría vía telefónica. También hay Espacios de Contacto Ciudadano (ECC) que se encuentran distribuidos en las 31 delegaciones estatales y en la Ciudad de México. 


Ejemplo de cómo sería la atención (Fuente: Flickr, CC BY 2.0)

Luego de obtener nuestro permiso o aviso debemos tener conocimiento de cómo es la zona en donde trabajaremos, o tener un guía que pueda apoyarnos. Lo ideal (si es que sabemos poco o nada de la zona) es contactar a una persona local que pueda apoyarnos, así se reducen riesgos.

Sí no conocemos la zona podemos investigar e informarnos acerca de lugares públicos cercanos (hospitales, tiendas o mercados) que nos sirvan como guía o referencia para la movilidad.

El material que necesitamos es el siguiente: 
  • Prensa de madera (30x45 cm)
  • Periódico (puede ser de cualquier periódico, pero La Prensa o La Jornada tienen el mejor tamaño)
  • Dos lazos o cinturones de algodón para el amarre
  • Cartón corrugado (con las perforaciones paralelas al lado corto y un poco más pequeño que la prensa)
  • Marcadores indelebles del color de preferencia (sirven marcadores, plumas Bic o lápices)
Periódico La Prensa

Prensa botánica

Plumones indelebles

Lazos de algodón


Cartón corrugado

Ahora la parte más importante: ¡Ir por nuestras plantas!
 
Dependiendo de nuestras necesidades (o tiempo) vamos a definir nuestro muestreo. Para colecta científica, se requieren: 
  • Las plantas que tengan flores
  • Las plantas que tengan frutos 
Bidens pilosa (Fuente: H. Vibrans, Malezas de México)
 
  ¿Por qué no recolectar plantas sin estas estructuras? Las plantas que no presenten estás estructuras difícilmente podrán identificarse, a menos que las conozcamos muy bien pero si somos principiantes es preferible no desafiar a la suerte. 

Luego, tendremos que definir en que zonas o hábitats vamos a recolectar. Por ejemplo, si estamos en un camellón solo vamos a colectar en el camellón que abarque una calle o si estamos en una avenida grande podríamos recolectar en ambas aceras pero que abarquen una zona.

En el caso de zonas rurales o monte es distinto. A menudo se evitan las zonas que delimitan al lugar (también conocidas como zonas de amortiguamiento) porque tienen interacción con el exterior y a nosotros posiblemente solo nos interesa el interior.

Obviamente esto se va a modificar dependiendo del porqué de la recolecta.

Para recolectar plantas es importantísimo escoger los mejores ejemplares. ¿A que me refiero? A aquellas plantas que no estén enfermas y bien desarrolladas (las que tengan estructuras reproductoras), como lo mencioné antes. Hay que arrancarlas (si son pequeñas, para incluir las estructuras subterráneas como raíces o cebollitas), cortarlas (si no es posible arrancarlas) o colectar estructuras representativas (si son plantas grandes). Generalmente, las guardamos en bolsas de plástico hasta que tengamos oportunidad para prensarlas.


Compañera colectando ejemplares

Compañero con ejemplares de recolecta

Los repeticiones (o no) en el mismo lugar deben de ser escogidas dependiendo de los intereses de cada uno. En mi caso para mi tema de tesis de maestría voy a hacer repeticiones por cada estación del año para ver el cambio de la vegetación con el paso de estás. A eso me refiero a que depende de los intereses personales y la asesoría que nos pueda brindar un experto.

Si la recolecta es para fines taxonómicos o florísticos es necesario que se colecten duplicados. Es decir, no solo llevaramos un ejemplar. Al momento de manipular la planta para su identificación muchas veces podemos dañarla, entonces está planta ya no podrá ser montada. A veces enviamos un ejemplar a un especialista para identificación. Y generalmente queremos dejar ejemplares a un o varios herbarios regionales y en un o varios nacionales. Un buen número de duplicados es cinco (claro, sin acabar con la población - generalmente no se debe llevar más que el 20% de una).

Después de recolectar se separan los organismos por morfotipo, es decir, se acomodan las plantas en grupos de acuerdo con sus características. En un grupo Asteraceae, en otro Fabaceae, en otro Poaceae y asi hasta que todas estén en un montón.

Pero esto (en mi experiencia en la taxonomía) lo llevábamos a cabo por localidad. Recorríamos la localidad colectando el material vegetal, al terminar el recorrido juntábamos el material DE SOLO ESA LOCALIDAD y era cuando lo separábamos, identificábamos (si era posible) y posteriormente hacíamos las anotaciones sobre el lugar, hábitat y características en las libretas de campo.

Compañeros acomodando el material recolectado y escribiendo una breve descripción de las plantas

Luego se van prensando y una persona anotará las características muy representativas y aquellas que se pueden perder o a simple vista no son notorias (aroma, color de las flores o si alguna parte de la planta tiene mucha agua) del individuo y si se conoce la familia o incluso el nombre científico también se anotarán. 


Ejemplo de libreta de campo con los nombres científicos de las plantas recolectadas

Ejemplo de libreta de campo con el número correspondiente y descripción de la planta recolectada 

Separación del material recolectado por morfotipo

Cuando prensa, se debe marcar el periódico de acuerdo con el número de la descripción que se hace en la libreta de campo con el marcador permanente. 

Uso de claves para la identificación en campo de plantas recolectadas.

Acomodamos cada una de las plantas en los periódicos con un cartón arrugada - o sea, planta en periódico-cartón-planta-cartón. Si colectamos muchas plantas y esto no es práctico, entonces se pueden juntar varias plantas entre un cartón, pero a la hora de secarlas hay que separarlas.
 
Cuando tengamos a todos las muestras en periódico podemos cerrar nuestra prensa, asegurando que este bien apretada para que nuestras plantas queden bonitas.

Cierre de la prensa botánica con los ejemplares colectados. Las correas están mal puestas en la imagen: la prensa debería estar volteada para que las cuerdas atraviesen los travesaños longitudinales, para no maltratar la prensa. 

Para finalizar, la prensa (ya cada planta con su cartón) se colocará en un lugar seco y con bastante calor por 10 días o hasta asegurarnos de que este bien secas nuestras plantas. Puede ser detrás de nuestro refrigerador o en nuestra azotea, pero teniendo bastante cuidado con las lluvias.

Pero de manera profesional se puede utilizar secadora, este tipo de herramientas las hay en los herbarios, como por ejemplo el CHAPA. En 2 a 3 días la mayoría de nuestras plantas pueden quedar completamente secas y en buen estado para ser manipuladas.

Cuando estén secas se podrán identificar y montar (si así lo deseamos) pero ese es tema para otro blog. La mayoría de los herbarios prefieren recibir los ejemplares sin montar, ya que tienen su propia técnica de montaje, así que hay que informarse previamente. Por el momento les comparto una imagen de cómo son ejemplares de herbario. :D

Ejemplares ya montados y listos para agregarse a la colección pertinente.


Otro temas interesantes: 

Bibliografía.

jueves, 28 de febrero de 2019

Planeación estratégica para herbarios

La Sociedad de Curadores de Herbarios, junto con iDigBio, ofrece un curso en línea cuyo propósito es el desarrollo de un plan estratégico para responsables de herbario. Dura 7 semanas, del 5 de abril hasta el 17 de mayo de 2019. Involucra 1 hora de asistencia virtual a una clase en línea, más 3-4 horas de trabajo en tareas. El cupo es de 15 participantes, y está en inglés. La fecha límite para inscripciones es el 18 de marzo.

Abajo reproduzco parte de la información en la página de iDigBio o de la Sociedad de Curadores
The “Strategic Planning for Herbaria” course will occur on Fridays from 2:00–3:00 Eastern Standard Time from April 5–May 17, 2019. We anticipate that the course will require 3–5 hours of work per week, including the 1 hour in-class. The goal is to produce a short (5–10 pages) strategic plan for each represented herbarium. Each plan will address vision, mission, stakeholders, strategies, goals, objectives, evaluation, and sustainability, among other things. The process is at least as valuable as the product, and you might find that the exercises benefit your herbarium in unexpected ways. This is the third year that this course will be offered. 

The course will be capped at 15 participants to ensure adequate opportunities to participate in discussions. We are looking for creative, committed participants who can help us to continue building momentum for this as an annual event. If multiple individuals from an herbarium are interested in participating in the course, we ask that one formally apply and the others participate in the out-of-class exercises and brainstorming sessions. 
 No dice nada sobre costos, así que supongo que es gratuito.

martes, 5 de febrero de 2019

Reanudación de las actividades en el Herbario-Hortorio CHAPA

La Dra. Mireya Burgos Hernández es la nueva encargada del Herbario-Hortorio del Colegio de Postgraduados, con la abreviatura CHAPA, desde hace medio año. En este tiempo ha avanzado con varias medidas para reactivar los trabajos del herbario. Además está buscando un estudiante que quisiera hacer su servicio social apoyando a las actividades.

Aquí les dejo las vías de contacto (correo-e, facebook, twitter y página web) y la convocatoria.



Para leer más:

lunes, 7 de enero de 2019

La vida en el herbario CHAPA

De Gabriel Cerén 

Edificio del posgrado en Botánica, Colegio de Postgraduados (COLPOS), campus Montecillo
En más de algún momento has escuchado la palabra "herbario" o incluso te ha tocado ayudar a tus hijos a elaborar uno.

Pero ¿Qué se hace en un herbario?

Acerquemos a la vida del herbario que esta ubicado dentro del Colegio de Postgraduados, Campus Montecillo.

Entrada del Herbario CHAPA
Un herbario es una colección de plantas deshidratadas de una región, país, continente o de todo el mundo, ordenada de tal manera que facilite su consulta. Es el registro fiel de la existencia de una especie vegetal en dichas áreas.

En el herbario CHAPA, en medio de los fríos muebles metálicos que quedan cerrados para disminuir el contacto con la luz que deterioran los especímenes, se encuentran más de 130,000 muestras de plantas de México y otras partes de América.
Muestra de Carex seatoniana L.H. Bailey
De las muestras históricas que se resguardan está Carex seatoniana, colectada el 28 de abril de 1898, por C.G. Pringle, en el Estado de Hidalgo, México.

M.en C. Ricardo Vega, obervado especímen histórico
El primer paso después de ir a campo, recolectar plantas con flores y frutos, tomar notas sobre la vegetación, ubicación y usos de cada una de las muestras, es llevarlas al herbario para el SECADO.

Secadora de plantas en herbario CHAPA
Cuando ya estan secas se agrupan en paquetes por colector y se dejan en una congeladora de -20°C por 72 horas. Esto garantiza la muerte de cualquier insecto que pueda afectar la demás colección.

Muestras deshidratadas, listas para ingresar a cuarentena (en la congeladora)
Una vez terminado este período se elabora la etiqueta. La identificación puede ser antes o después: familia, género, especie y/o niveles más bajos dependiendo de la muestra. La etiqueta es una parte integral del ejemplar; si no se sabe dónde y cuándo se colectó, carece de valor.
Datos básicos de una etiqueta botánica
Paso seguido se monta la muestra. Existen diferentes técnicas. En el CHAPA esto consiste en pegar la planta al carton para montaje, y luego se fija con unas puntadas con hilo de algodón, preferentemente.

Sra. Lucía Viana en montaje de muestras en el herbario
Muestra montada
Muestras listas para intercalar

Después se intercalan en carpetas, una o varias carpetas para cada especie, y agrupados en géneros y familias botánicas.

Orden de los carpetas por especie
Pasillo principal del Herbario CHAPA y área de identificación
Poster en herbario CHAPA
Los usos que se le pueden dar a las muestras del herbario son múltiples. Son la base principal para las descripciones de nuevas especies para la ciencia, ayudan a hacer mapas de distribución, catálogos de plantas, revisiones taxonomicas, contribuyen datos sobre fenología (las fases de las plantas, p.ej. cuando florecen) o palinología (acerca del polen), son depósitos para comprobantes para otros trabajos, por ejemplo, de plantas medicinales, y también sirven para fines educativos e informativos. El uso más común es para la identificación de especímenes en trabajos ecológicos, florísticos o etnobotánicos.

El herbario Hortorio CHAPA te espera los días lunes a viernes de 8:00 am a 3:00 pm. La actual curadora es la Dra. Mireya Burgos Hernández, y el curador técnico es el M. en C. Ricardo Vega. El correo-e es chapa@colpos.mx y el teléfono 01-595-95 20200 ext. 1322.

También te puede interesar:

Herbario CHAPA
Dr. Stephen D. Koch

viernes, 26 de enero de 2018

Video de fin de semana: cómo prensar plantas

El jardín botánico de Edinburgo tiene un video bonito e instructivo sobre el proceso de colectar y prensar plantas para fines de documentación botánica, y hacer ejemplares de herbario. En inglés.



miércoles, 22 de febrero de 2017

El HERITH, un herbario regional

De Ivan Daniel Salas Mendez 

Logo institucional del Herbario HERITH

Mi nombre es Iván Daniel, de lunes a viernes yo era feliz en el herbario institucional de mi escuela donde me formaba como biólogo, colaborando como determinador. Ingresé en el mes de abril del 2012 y finalizé en diciembre del 2015. Para mi el herbario era mi refugio donde reía, lloraba, aprendía y disfrutaba cada encuentro con las plantas, con mis compañeros y con la curadora de tal lugar.

Les compartiré un poco de historia y el andar del HERITH por la Huasteca Hidalguense.

El Herbario del Instituto Tecnológico de Huejutla en el estado de Hidalgo tiene el acrónimo HERITH. Se fundó en enero de 1999, por iniciativa individual de la Bióloga Sol de Mayo Araucana Mejenes-López, quien fue responsable del acervo hasta el 2 de julio del 2014. En abril de 2002 se obtuvo el registro formal ante SEMARNAT (clave HGO-FLO-124-04-02).

Registro del acervo ante SEMARNAT

Primeros estudiantes del HERITH de residencia profesional realizando
trabajo de laboratorio y gabinete

El herbario pretende establecer y consolidar una colección de flora de forma activa, educativa y de estudios científicos que represente la región Huasteca y Sierra de Hidalgo. Igualmente, quiere impulsar y difundir el conocimiento de la flora regional.

Ejemplares depositados en el Herbario HERITH

El acervo ha contado con la participación eficaz de estudiantes de la Licenciatura en Biología desde 1999 hasta hoy en día en las modalidades de servicio social, residencia profesional y tesis.

Alumnos y equipo desarrollando actividades de campo

Los estudiantes provenientes de varios lugares de la Huasteca y Sierra de Hidalgo han contribuido directamente en el incremento del acervo.

Región sierra y huasteca de Hidalgo 


La colección cuenta con un área de 36 m2, la cual consta de dos gabinetes tipo herbario y tres gavetas de resguardo, una estufa de madera, un acervo de literatura  (libros, monografías, artículos, Floras nacionales, claves dicotómicas, revistas, entre otros). El acervo está conformado por 1476 ejemplares y estos a su vez estan distribuidos en 106 familias botánicas, 266 géneros y 295 especies. 

El Herbario HERITH se fumiga con químicos y la revisión de los ejemplares es cada tres meses.


Gavetas con ejemplares y estereoscopios

Computadora, material de laboratorio, literatura y logo del HERITH
Se tiene un manejo permanente de actualización, manejo y mantenimiento del acervo. 


Desde 1999 hasta la fecha los trabajos han sido enfocados principalmente en listados taxonómicos en sitios de de vegetación de Selva Mediana Subperennifolia y Bosque Mesófilo de Montaña.
Tesistas y residentes profesionales monitoreando la flora de la región

Prensado de ejemplares en Selva Mediana Subperennifolia

Recorrido en sitios de muestreo
La participación en foros académicos científicos forma parte fundamental para la colección de flora, como la intervención de ferias ambientales, Semanas Nacionales de Ciencia y Tecnología, encuentros de Herbarios, de Investigación y Desarrollo Tecnológico y Congresos Nacionales e Internacionales de Etnobiología y Botánica.

 
Promoción del Herbario HERITH

Feria ambiental en Huejutla de Reyes, Hidalgo

Pláticas sobre flora regional a niños de primaria
Participando en el IX Congreso Mexicano de Etnobiología en
San Cristóbal de las Casas, Chiapas
Actualmente la curadora del Herbario es la doctora Dorismilda Martínez Cabrera. La consulta de ejemplares es de lunes a viernes con horario de 9:00 a 14:00 horas.

En conclusión, la colección del Herbario pretende ser un acervo, cuyos propósitos estan encaminados a la docencia e investigaciones científicas así como difusión a corto, mediano y largo plazo para proponer un manejo acorde a la región de los recursos florísticos de la región Huasteca y Sierra de Hidalgo.

Actualmente el HERITH lleva el nombre de quien inició este proyecto
(Sol de Mayo Araucana Mejenes-López)


CONTACTO
Herbario (HERITH)
Instituto Tecnológico de Huejutla,
Carretera Huejutla-Chalahuiyapa, Km 5.5
Huejutla de Reyes, Hidalgo
Teléfono: (01-789) 896-06-48
Email: dir_huejutla@tecnm.mx




GRACIAS HERITH...

Por todos los momentos vividos ahí,

por permitirme conocer gente extraordinaria y que marcó mi vida,

por mostrarme las maravillas del reino vegetal,

por traer consigo grandes satisfacciones profesionales y personales,

pero principalmente por formarme como Biólogo.

IVAN DANIEL SALAS MENDEZ