Coloquio: La computadora en el herbario. Reflexiones de 57 años de trabajo

De Santa Lucía Quintero Bastida

Este año 2024 el Instituto de Biología de la Universidad Nacional Autónoma de México (IBUNAM) cumple 95 años desde su fundación. Es una de las grandes instituciones de investigación en materia biológica a nivel nacional. Su principal propósito ha sido el estudio de la composición, distribución, origen y usos potenciales de biodiversidad de México. El IBUNAM tiene a su resguardo las siguientes colecciones y bases de datos.

1. Herbario Nacional de México (MEXU)
2. Colecciones zoológicas 
3. Colecciones vivas del jardín botánico
4. Unidad de informática para la biodiversidad (UNIBIO)

Figura 1. Logo 95 aniversario IBUNAM
Fuente: IBUNAM 

Las colecciones que resguarda el Instituto de Biología son consideradas patrimonio documental y científico de la nación, ya que es ahí donde se encuentra depositado el mayor acervo de información sobre la biodiversidad mexicana. 

Figura 2. La computadora en el herbario
Fuente: IBUNAM

En el marco de su 95 aniversario el IBUNAM se complace en invitar al coloquio “La Computadora en el Herbario. Reflexiones de 57 años de trabajo” que tendrá lugar el 2 y 3 de mayo en el auditorio del Jardín Botánico en C.U. En dicho evento destacados expertos compartirán sus experiencias sobre investigaciones y los logros que han tenido en el camino a la sistematización informática de los herbarios en México.

 

Figura 3. Chip de computadora (alusivo a la importancia de la sistematización informática de los herbarios)
Fuente: IBUNAM 

Ubicación del evento: Auditorio del Jardín Botánico del Instituto de Biología, UNAM

A continuación se presenta parte del programa de ponencias del evento. Puedes consultar el programa completo aquí

Te presentamos algunos de los ponentes que compartirán sus experiencias, avances y aportes a la sistematización de la información en materia biológica. 

Ponente: Dr. José Luis Villaseñor Ríos

Institución: Departamento de Botánica, IB-UNAM 

Título de la ponencia: El uso de las bases de datos de herbarios en el análisis de la biodiversidad 

Fecha y hora: 2 de mayo de 2024 de 9:45 - 10:30 hrs

Semblanza curricular: Botánico con estudios de posgrado en la UNAM y en el extranjero (California, USA). Desde 1991 investigador del Departamento de Botánica, Instituto de Biología, UNAM. Es miembro del SNII desde 1986 (a partir de 2024 Investigador Emérito). Sus líneas de investigación son la Sistemática Vegetal, la Fitogeografía, la Biología de la Conservación y la Informática de la Biodiversidad, orientados a evaluar los patrones, tanto de riqueza de especies como de distribución geográfica, ya sea a escala local, regional o nacional. Es autor o coautor de 300 publicaciones, entre las que destacan 245 artículos, 14 libros y 17 capítulos de libros. 

Ponente: Dra. Victoria Sosa Ortega

Institución: INECOL 

Título de la ponencia: eFloraMEX: la flora electrónica de México; "Implementación de la eFloraMEX en la plataforma EDIT" 

Fecha y hora: 3 de mayo de 2024 de 9:00 - 9:30 hrs 

Semblanza curricular: Victoria Sosa estudió la licenciatura en biología por la UNAM y el doctorado en ciencias por la Universidad de California, Berkeley. Actualmente es Investigadora Titular D en el Instituto de Ecología AC, INECOL, de Xalapa, Veracruz. e Investigadora Emérita del Sistema Nacional de Investigadores. Ha publicado 120 artículos indizados y 51 publicaciones de índole taxonómica, divulgación y enseñanza. Ha dirigido 38 tesis (15 de doctorado). Profesora titular en cursos de taxonomía y sistemática del posgrado del INECOL. Ha participado en diversas comisiones evaluadoras y comités directivos nacionales e internacionales, como la Red Latinoamericana de Botánica. Fungió como Presidenta de la Sociedad Botánica Mexicana. 

Ponente: Enrique Ortiz Bermúdez

Institución: Departamento de Botánica, IB-UNAM 

Título de la ponencia: La Identificación automatizada, AbaTax 

Fecha y hora: 3 de mayo de 2024 de 12:20 - 12:50 hrs 

Semblanza curricular: Es Biólogo y Maestro en Ciencias por la Facultad de Ciencias de la Universidad Nacional Autónoma de México. Se ha especializado en el manejo de sistemas de información geográfica y percepción remota. Sus áreas de estudio son la Biogeografía, Bioinformática, Florística, Sistemática de la Conservación y Taxonomía y Sistemática Filogenética. 

Conoce a todos los ponentes aquí

Registro

Es importante registrarse para reservar un lugar en el evento ya que el recinto tiene un aforo de 100 personas. ¡El registro es totalmente gratuito!

Si no puedes asistir de forma presencial, no te preocupes, puedes seguir la transmisión en vivo a través del canal del IB UNAM @SeminariosIB en Youtube

¡No te lo pierdas!

Para más información consulta el sitio: La computadora en el herbario. Reflexiones de 57 años de trabajo

¿Hay cactus en El Salvador?

De Gabriel Cerén López 

Comunidad de Opuntia guatemalensis en  las cercanias de la playa en La Unión

Seguramente cuando escúchas la palabra cactus, los lugares que se vienen al recuerdo son México y Brasil, dos grandes centros de diversificación de la familia botánica Cactaceae, la cual es endémica del continente Americano.

Pero cuando hablaba del proyecto de Diversidad de cactus en El Salvador, la mayoria de personas siempre me preguntaban: ¿Hay cactus en El Salvador?, ¿no creo que existan muchas especies?

Precisamente estas interrogantes y dudas son las que nos motivaron para hacer un convenio entre el Museo de Historia Natural de El Salvador y el Jardín Botánico del Instituto de Biología de la UNAM, que nos llevó a una aventura de dos años de investigación entre el 2012 al 2014.

Sitios de recolecta de cactus en El Salvador

Revisiones bibliográficas y de herbarios locales e internacionales donde se habían depositado muestras, nos llevó a tener la idea de las especies registradas así como también dirigir los esfuerzos de recolecta e investigación.

Especies registradas de cactus para El Salvador

Iniciamos visitando Areas Naturales Protegidas y áreas privadas en búsqueda de poblaciones que nos ayudaran a documentar la mayor cantidad de especies en el país.

Recolecta de cactus en Complejo Taquillo, Jicalapa, La Libertad

Recolecta de muestras en San Gerónimo, La Unión

Algunas de las especies encontradas están:

Nombre común: saite. Nombre Científico: Acanthocereus tetragonus (L.) Hummelinck

Nombre común: cola de mono. Nombre científico: Acanthocereus hirschtianus (K. Schum.) Lodé

Nombre cientifico: Disocactus aurantiacus (Kimnach) Barthlott

Nombre científico: Disocactus speciosus subsp. cinnabarinus (Eichlam ex Weing.) Ralf Bauer

Uno de los hallazgos de este estudio fué el registro del género Mammillaria, el cual no se tenia conocimiento de su presencia en territorio salvadoreño.

Nombre científico: Mammillaria columbiana subsp. yucatanensis (Britton & Rose) D.R. Hunt

Nombre científico: Mammillaria voburnensis Scheer subsp. voburnensis

Nombre común: órgano. Nombre científico: Marshallocereus aragonii (F.A.C. Weber) Backeb.

Nombre común: tuna. Nombre científico: Opuntia lutea (Rose) D.R. Hunt

Nombre común: matial, tirabuzón. Nombre científico: Pereskia lychnidiflora DC.

Nombre común: viejito. Nombre científico: Pilosocereus leucocephalus (Poselg.) Byles & G.D. Rowley

Nombre científico: Selenicereus glaber (Eichlam) S. Arias & N. Korotkova

Uno de los grandes aciertos de este esfuerzo de investigación fué la publicación de una nueva especie.

Nombre científico: Disocactus salvadorensis Cerén, J. Menjívar & S. Arias

Actualmente se esta trabajando la segunda especie nueva, la cual esperamos que pronto sea publicada y otra más que esta en estudio. Esto nos demuestra la importancia de impulsar estudios sistemáticos de las familias botánicas presentes en El Salvador. Este proyecto terminó en la publicación del libro Diversidad de cactus en El Salvador, si lo quieres leer y revisar te invito a que lo bajes.


Referencia

Cerén López, J.G., Arias Montes, S. y Menjívar Cruz, J.E. 2015. Diversidad de cactus de El Salvador. Museo de Historia Natural, San Salvador, El Salvador.

Para leer más:

• De cómo llegamos a una especie nueva
• Los incomparables agaves y cactos
• Nuestros cactus portándose mal en otras casas
• Las nuevas especies de plantas mexicanas de 2015 - Cactaceae
• Cactus en la niebla

Guias para plantas de Ecuador

La sección "Recursos" de la página web del XXII Congreso Latinoamericano de Botánica contiene varios enlaces a documentos útiles para botánicos.

Por ejemplo, incluye una sinopsis de los datos de los diferentes herbarios de aquel país. Y ya se pueden bajar las memorias del congreso (pero cuidado - ¡son casi 700 páginas y más de 100 megas!).

En esta sección, acabo de descubrir un pequeño trabajo muy bonito (y que debemos tomar como ejemplo para otros países), obra de Carmen Ulloa. Es una presentación que ofrece una gran cantidad de enlaces a diferentes guías y manuales, útiles para botánicos.

Vayan a explorarlo. Aquí va la portada y dos de las páginas como ejemplo:

Manuales de malezas para Ecuador

En el actual XII Congreso Latinoamericano de Botánica se presentó un nuevo manual de malezas para los cultivos más importantes de Ecuador, el país anfitrión. Cubre a 93 especies; la mayoría también las conocemos en México.

Aquí como ejemplo, el tratamiento de Cenchrus echinatus, el codillo:

Indagando un poco más, encontré todavía otro manual, ahora de las malezas e invasoras de las Islas Galápagos. Cubre a 31 especies.

Y como ejemplo, una especie que también nos da muchos problemas en México, Bryophyllum pinnatum (= Kalanchoe pinnata):

Ambas publicaciones están orientadas principalmente al combate, pero, claro, también sirven para la identificación.


Referencias

Fundación Charles Darwin y Servicio Parque Nacional Galápagos (2006). Manual de Identificación y Manejo de Malezas. Fundación Charles Darwin, Quito.

Santillán, M. (2017). Manual de malezas presentes en cultivos de importancia económica del Ecuador. Agrocalidad. Quito, Ecuador. (tarda, es un archivo grande)

Toda la filogenia en un solo cartel

Un grupo de botánicos europeos ha producido un cartel que muestra las relaciones filogenéticas (o sea, de parentesco) de las angiospermas (plantas con flor) según APG IV, así como las características más importantes que distinguen a los grupos. Está muy bonito. La versión abajo es reducida. Pueden bajar el original aquí, que es para imprimir un cartel de 120 x 85 cm, aproximadamente.

La filogenia de las angiospermas

¿Qué será de las bibliotecas (científicas)?

Yo soy de una generación que venera a los libros. Y que gastaba una buena parte de su dinero - disponible o no - en ellos. Sin embargo, he notado que en los últimos años, ya compro muy pocos. Todo está en línea ...

Recientemente, estuve pensando sobre el tema de los libros, impulsado por un conflicto entre libros y espacios en mi institución. Estoy viendo que los libros siguen un poco el camino de los discos de vinilo, estos negros grandes que tenías que poner en un tocadiscos. Ubicuos en un momento, luego, guardados en cajas en el sótano, los que se sacan cuando alguien se muere, y en el siguiente momento objeto de colección de algunos aficionados como símbolos de nostalgia.

Pero, libros científicos y sus bibliotecas, incluyendo las particulares de los investigadores, son un caso especial. Allí está documentado la base de nuestro conocimiento. Específicamente en la botánica taxonómica, dependemos mucho de obras viejas y monografías de bajo tiraje. Una buena parte de estos trabajos no están en línea, y prácticamente invisibles para el internauta. Existen esfuerzos para subir obras históricas a la red, como JSTOR, BHL o el Internet Archive, pero están incompletos, y su permanencia no está garantizado. Para libros más recientes, digamos, entre 1930 y 1990, hay muchos problemas con el derecho de autor. Por ejemplo, la Flora Novo-Galiciana sigue siendo disponible solo en papel.

Hay otro asunto. Todos nos hemos acostumbrado tanto a la red que no nos podemos imaginar un mundo sin él, o con restricciones para acceder. Sin embargo, esto puede pasar muy fácilmente, ya sea por razones técnicos o políticos.  Ya se ven algunas nubes muy negros en el horizonte, desde varios megahackeos, secuestros cibernéticos, sabotajes, hasta la censura en China, la manipulación de la opinión política de Facebook, las intervenciones en las redes sociales en el Cercano Oriente, hasta el corte (accidental o a propósito) de cables que transmiten datos.

Claro, libros también se pueden quemar y
censurar. De hecho, esto ha sido una constante a lo largo de la historia. Pero, es mucho más difícil erradicar completamente algún conocimiento específico por la naturaleza dispersa de libros. En el internet es relativamente más fácil. Controlar la información es una de las maneras más antiguas para ejercer poder y no creo que la naturaleza humana haya cambiado.

Entonces, ¿qué haremos con estas cantidades grandes de objetos, que posiblemente tendrán un valor en algún momento para alguien? Recuérdense que guardar cosas en condiciones adecuadas también tiene su costo, que alguien tiene que cubrir.

Creo que es un tema que se debe tratar en conjunto, entre la comunidad científica entera, quizás representados por el CONACyT, las instituciones y los individuos.

Me podría imaginar las siguientes acciones:
- que el CONACyT designe y apoye a bibliotecas regionales, quizás a nivel estatal, que colecten activamente a los libros científicos y a las cuales uno puede donar (claro, no se colectarán duplicados, y posiblemente se quedan en bodegas apropiadas, pero estarían registrados y accesibles cuando se requieran).

- las instituciones podrían contribuir orientando su política a guardar obras básicas, y estar conscientes que el internet no necesariamente es para siempre en la misma forma como es actualmente.

Y qué podríamos hacer nosotros? Una acción importante de los investigadores mayores sería organizar el destino de libros, archivos y fotos antes de jubilarse o, pues sí, morir.

Una posibilidad que podríamos probar sería organizar tianguis de libros en nuestros respectivos congresos, donde los jóvenes interesados podrían adquirir por una cantidad simbólica, las obras que ya dieron servicio a otros.



¿Qué piensan ustedes? ¿Sobre todo los más jóvenes? Dejen sus comentarios.

¿Quieres identificar plantas tropicales?

Pues aquí te enseñan cómo.

Los cursos organizados por la Sociedad Botánica de México en coordinación con varias universidades del país y apoyados por CONACyT han sido todo un éxito a lo largo del año.

El último se llevará a cabo en Chiapas, del 26 al 28 de octubre de 2018, y será dedicado a dar herramientas para identificar plantas del trópico.

Puede participar cualquier interesado, pero estudiantes de biología o ecología que son miembros de la Sociedad Botánica de México pueden obtener apoyos (claro, te puedes hacer miembro para esto). Aquí hay más información. El correo de contacto es sbmregistro@gmail.com.

La historia del nunca acabar - de la taxonomía

A mucha gente le parece misterioso por qué es que los biólogos todavía no conocen a todas las especies que habitan este planeta. Al fin que son "solo" algunos millones, y en algunos grupos, como las plantas superiores, son "solo" algunos cientos de miles, cantidades menores comparados con otros campos de conocimiento o de acumulación de datos.

Me gustó mucho esta infográfica que resume los pasos del proceso de describir una nueva especie. El ejemplo es de insectos, pero es similar para plantas:

La historia del nunca acabar - de la taxonomía. Tomado de Figshare
Autores: Jason Dombroskie y Amanda Roe

El problema básico es encontrar no solo las diferencias entre grupos de bichos, sino las diferencias importantes, lo cual, hasta ahora, requiere el juicio de una persona altamente entrenada. Y hay pocos de ellos, los taxónomos. No se puede automatizar esta búsqueda.

Durante algún tiempo hubo mucho entusiasmo que los datos moleculares y genéticos nos iban a hacer más fácil la división de la diversidad de seres vivos en unidades o especies, incluso hacerla casi automático con la ayuda de algunos algoritmos. Es posible que todavía lleguemos a este nivel. Pero, hasta la fecha resulta que estos datos simplemente son otra herramienta más y que tienen que ser evaluados, ahora por una persona todavía más altamente entrenada (en métodos tanto morfológicos como moleculares).

Así que es una historia del nunca acabar - al menos que algún día tengamos suficientes taxónomos entrenados, lo cual no parece probable. ¿Curioso, no? Cómo los humanos dedicamos muchisimo esfuerzo a desarrollar iPads o tecnología destructiva, pero no queremos apartar para conocer y entender nuestros compañeros de vida, sin los cuales no estaríamos aquí.

Los chicalotes hibridizan

Los chicalotes, el género Argemone en las Papaveraceae, son muy conocidos en México. Tienen flores vistosas, espinas, son comunes y se usan ampliamente como medicinales. Tenemos un poco más que veinte especies en México, pero son dos las que son más ampliamente distribuidas: Argemone mexicana con flores color amarillo fuerte y una distribución más tropical, y Argemone ochroleuca, con flores color crema y una distribución en altitudes medias a altas (se encuentra a menudo en la vegetación urbana de la Ciudad de México, sobre todo del oriente, pero no sube mucho en las laderas; en las partes altas se encuentra la muy bella Argemone platyceras). Ambas especies se encuentran actualmente en muchas partes del mundo tropical y son invasoras.

Resulta que estas dos especies hibridizan, y los híbridos resultantes son vigorosos. Ya ha sido reportado de varias partes del mundo (menos de México), pero ahora se describió el taxon formalmente como Argemone x hybrida, de unas poblaciones en las islas Canarias, España. Aquí hay una ilustración de los padres y de esta nueva entidad:

Creo que debemos buscar este híbrido en México también, ya que las dos especies a menudo se presentan en cercanía. De hecho, una vez vi una población en Morelos que se me hacía rara, pero no le hice mucho caso. Ahora, leyendo el artículo, creo que se trató de poblaciones de los dos padres más intermedios.

El artículo está bonito y detallado (aunque en inglés). Si les interesan las malezas, vayan a leerlo. Es de acceso libre.

Referencia


Otto R. y F. Verloove (2016) A new natural hybrid in Argemone (Papaveraceae). Phytotaxa 255:57. doi: 10.11646/phytotaxa.255.1.5

El HERITH, un herbario regional

De Ivan Daniel Salas Mendez 

Logo institucional del Herbario HERITH

Mi nombre es Iván Daniel, de lunes a viernes yo era feliz en el herbario institucional de mi escuela donde me formaba como biólogo, colaborando como determinador. Ingresé en el mes de abril del 2012 y finalizé en diciembre del 2015. Para mi el herbario era mi refugio donde reía, lloraba, aprendía y disfrutaba cada encuentro con las plantas, con mis compañeros y con la curadora de tal lugar.

Les compartiré un poco de historia y el andar del HERITH por la Huasteca Hidalguense.

El Herbario del Instituto Tecnológico de Huejutla en el estado de Hidalgo tiene el acrónimo HERITH. Se fundó en enero de 1999, por iniciativa individual de la Bióloga Sol de Mayo Araucana Mejenes-López, quien fue responsable del acervo hasta el 2 de julio del 2014. En abril de 2002 se obtuvo el registro formal ante SEMARNAT (clave HGO-FLO-124-04-02).

Registro del acervo ante SEMARNAT

Primeros estudiantes del HERITH de residencia profesional realizando
trabajo de laboratorio y gabinete

El herbario pretende establecer y consolidar una colección de flora de forma activa, educativa y de estudios científicos que represente la región Huasteca y Sierra de Hidalgo. Igualmente, quiere impulsar y difundir el conocimiento de la flora regional.

Ejemplares depositados en el Herbario HERITH

El acervo ha contado con la participación eficaz de estudiantes de la Licenciatura en Biología desde 1999 hasta hoy en día en las modalidades de servicio social, residencia profesional y tesis.

Alumnos y equipo desarrollando actividades de campo

Los estudiantes provenientes de varios lugares de la Huasteca y Sierra de Hidalgo han contribuido directamente en el incremento del acervo.

Región sierra y huasteca de Hidalgo 

La colección cuenta con un área de 36 m2, la cual consta de dos gabinetes tipo herbario y tres gavetas de resguardo, una estufa de madera, un acervo de literatura  (libros, monografías, artículos, Floras nacionales, claves dicotómicas, revistas, entre otros). El acervo está conformado por 1476 ejemplares y estos a su vez estan distribuidos en 106 familias botánicas, 266 géneros y 295 especies. 

El Herbario HERITH se fumiga con químicos y la revisión de los ejemplares es cada tres meses.

Gavetas con ejemplares y estereoscopios

Computadora, material de laboratorio, literatura y logo del HERITH

Se tiene un manejo permanente de actualización, manejo y mantenimiento del acervo. 

Desde 1999 hasta la fecha los trabajos han sido enfocados principalmente en listados taxonómicos en sitios de de vegetación de Selva Mediana Subperennifolia y Bosque Mesófilo de Montaña.

Tesistas y residentes profesionales monitoreando la flora de la región

Prensado de ejemplares en Selva Mediana Subperennifolia

Recorrido en sitios de muestreo

La participación en foros académicos científicos forma parte fundamental para la colección de flora, como la intervención de ferias ambientales, Semanas Nacionales de Ciencia y Tecnología, encuentros de Herbarios, de Investigación y Desarrollo Tecnológico y Congresos Nacionales e Internacionales de Etnobiología y Botánica.
 

Promoción del Herbario HERITH

Feria ambiental en Huejutla de Reyes, Hidalgo

Pláticas sobre flora regional a niños de primaria

Participando en el IX Congreso Mexicano de Etnobiología en
San Cristóbal de las Casas, Chiapas

Actualmente la curadora del Herbario es la doctora Dorismilda Martínez Cabrera. La consulta de ejemplares es de lunes a viernes con horario de 9:00 a 14:00 horas.

En conclusión, la colección del Herbario pretende ser un acervo, cuyos propósitos estan encaminados a la docencia e investigaciones científicas así como difusión a corto, mediano y largo plazo para proponer un manejo acorde a la región de los recursos florísticos de la región Huasteca y Sierra de Hidalgo.

Actualmente el HERITH lleva el nombre de quien inició este proyecto
(Sol de Mayo Araucana Mejenes-López)

CONTACTO
Herbario (HERITH)
Instituto Tecnológico de Huejutla,
Carretera Huejutla-Chalahuiyapa, Km 5.5
Huejutla de Reyes, Hidalgo
Teléfono: (01-789) 896-06-48
Email: dir_huejutla@tecnm.mx

GRACIAS HERITH...

Por todos los momentos vividos ahí,

por permitirme conocer gente extraordinaria y que marcó mi vida,

por mostrarme las maravillas del reino vegetal,

por traer consigo grandes satisfacciones profesionales y personales,

pero principalmente por formarme como Biólogo.

IVAN DANIEL SALAS MENDEZ